O Mestrado Profissional em Ensino de Ciências tem caráter de preparação profissional na área docente, com foco no ensino, na aprendizagem, nas metodologias o ensino, a aprendizagem, metodologias pedagógicas, tecnologias digitais e o uso de espaços não formais, sempre referenciando o ensino de ciências nas áreas de Biologia, Física e Química. Está voltado, explicitamente, para a evolução e melhoria da educação de Ciências no estado de Roraima, bem como nas áreas de pesquisa e investigação de temas relevantes para o ensino de Ciências Naturais, seja pela ação direta em sala de aula, seja pela contribuição na solução de problemas educativos em ciências, nos níveis médio e fundamental, e no nível superior na formação de professores de Licenciatura em Biologia, Física, Química ou área afim.